Γυναικωνίτης, είναι το μέρος των χριστιανικών ναών το οποίο προορίζεται μόνο για γυναίκες. Είναι είτε υπερώο είτε κάποιο από τα κλίτη του ναού και στις παλιές εκκλησίες χωριζόταν από ένα διχτυωτό παραπέτασμα, που επέτρεπε σ’ αυτές να παρακολουθούν τη λειτουργία χωρίς να φαίνονται.
Σήμερα, η συνήθεια αυτή έχει εκλείψει και οι γυναίκες εκτός από το γυναικωνίτη, εκκλησιάζονται και σε άλλα μέρη του ναού.

Γυναικωνίτης ονομαζόταν στην αρχαία Ελλάδα το ιδιαίτερο διαμέρισμα του σπιτιού, στο οποίο έμεναν οι γυναίκες. Τέτοιο διαμέρισμα έχουν και τα μουσουλμανικά σπίτια. Οι γυναικωνίτες των μουσουλμάνων είναι γνωστοί ως χαρέμια. Οι Τούρκοι είχαν στα σπίτια τους γυναικωνίτες μέχρι την εποχή του Κεμάλ, που τους κατάργησε